מרכז בס"א נוסד בשנת 1993 על-ידי ד"ר תומס הכט, ממנהיגי הקהילה היהודית הקנדית, כמכון מחקר עצמאי ולא-מפלגתי המסונף לאוניברסיטת בר-אילן. שמו של המכון נבחר לזכרם של מנחם בגין ואנואר סאדאת, שבמאמציהם להביא שלום לאזור הניחו את אבן הפינה לתהליך פיוס היסטורי בין ישראל לבין שכנותיה הערביות.
בעשרים השנים האחרונות הפיק המכון יותר מ-750 מחקרים וניירות עמדה מקוריים וכן עשרים וחמישה ספרים. המכון ערך יותר מ-600 ימי עיון וכינוסים בין-לאומיים עבור מומחים במערכת הביטחון, אנשי מודיעין, מומחים למדיניות חוץ, דיפלומטים, אנשי עסקים, אנשי אקדמיה ופוליטיקאים.